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一、培訓(xùn)班上課內(nèi)容 
      上課內(nèi)容涵蓋“基因組學―蛋白質(zhì)組學―系統(tǒng)生物學”的研究方法、技術(shù)思路、前沿進展及其在各生物學科中的應(yīng)用。 
核心課程包括： 
1. 基因組的比較研究、DNA測序技術(shù)原理與進展（講課人：于 軍 教授） 
2. 轉(zhuǎn)錄組的測定與分析、大規(guī)模測序方法及應(yīng)用、微生物基因組學、基因組學與醫(yī)學（講課人：胡松年教授） 
3. 系統(tǒng)生物學建模分析及高通量分析技術(shù)應(yīng)用（講課人：楊軍、陳銘教授等） 
4. 蛋白質(zhì)組學概論及應(yīng)用 （講課人：鐘伯雄教授）

二、培訓(xùn)班上機內(nèi)容 
      上機實習課采用 “跟我學”方式，學習實踐各類基礎(chǔ)生物信息學軟件，每人一臺PC機跟著大屏幕一步步學會基因組、蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)分析的基本方法。

主要內(nèi)容如下： 
實習一： 基因組數(shù)據(jù)注釋和功能分析
      通過序列比對工具BLAST的學習，了解基因功能注釋的原理；介紹多序列聯(lián)配工具ClustalX及分子進化分析軟件MEGA4，掌握系統(tǒng)發(fā)生樹繪制的基本方法，認識基因復(fù)制在進化上的功能；學習基因序列分析常用的數(shù)據(jù)庫和軟件。 
實習二： 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析
      介紹轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析的基本流程及其原理；通過對tophat、cufflinks、R等轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析工具的介紹及演示，了解基于二代測序數(shù)據(jù)的轉(zhuǎn)錄組分析流程及常用分析方法； 利用kegg、GOstat、DAVID等在線工具挖掘轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的生物學意義。 
實習三：系統(tǒng)生物學軟件實習-----網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)顯示與分析 
      利用Cytoscape系統(tǒng)生物學分析軟件，分析蛋白－蛋白相互作用，展示分子網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)，并與基因表達等數(shù)據(jù)整合。 
實習四：蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能分析 
      從數(shù)據(jù)庫搜索感興趣的蛋白質(zhì)氨基酸序列開始，接著對蛋白質(zhì)基本理化性質(zhì)、二級結(jié)構(gòu)、和三維空間結(jié)構(gòu)和序列模體進行分析，預(yù)測目標蛋白的生物功能。 
實習五： 蛋白質(zhì)組質(zhì)譜分析 
      使用X！Tandem、Mascot、Sequest等軟件鑒定蛋白質(zhì)質(zhì)譜數(shù)據(jù)，將質(zhì)譜結(jié)果匹配到蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫鑒定蛋白；使用TPP軟件包進行統(tǒng)計學分析和優(yōu)化檢索結(jié)果練習。

三、培訓(xùn)對象 

無生物信息學背景，希望了解生物信息學的學員； 
計劃開展各類組學研究的科研人員； 
已有組學數(shù)據(jù)需了解分析方法的研究人員； 
有志從事生物信息學相關(guān)工作的學生或者技術(shù)人員。